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到了1920年初，爪哇岛上的疫情和饥荒随着人口数量的大幅度消失，也逐渐消失了，这时候，爪哇岛上存活的居民人口数量不足300万，而且大多数都隐藏在了比较偏僻的山区里，沿海的港口城市和主要城市都已经无人居住，大片的种植园和农田也都处于荒废状态。()请使用访问本站。爪哇岛的经济和政治遭到彻底的破坏，完全处于无政府状态，钱币不再流通，岛上的居民重新采用了以货易货的原始交易形式，并且交易量非常少，基本都是自给自足，很少和外界交往。

为了进一步确定爪哇岛上的疫情，联邦政府没有急于登上爪哇岛，而是加大了登岛的防化部队的数量和频率，在经过了半年左右的观察和确认之后，才初步确定了这次大规模长期的细菌战的结果，并且由内务部起草了一份报告，呈交给了刘芾，并在报告中申请降低爪哇岛的封锁级别，并建议总统，可以对爪哇岛进行初步占领并展开勘查活动，再进一步确认疫情的发展和效果。

刘芾在拿到这份报告后，也有点让自己当初的决定给吓住了，一个岛上，2千多万人口，在短短的三年时间里，被杀戮得只剩下不到300万人，这种效率简直比机关枪大炮要强多了，而且还是悄无声息的，这简直太恐怖了，怪不得到了后世，世界各国一直同意，禁止使用细菌武器呢，这个玩意比原子弹还可怕。成本又如此之低，真是抄家灭族的不二之选。

想起这种特殊武器的威力，刘芾忍不住向墙上的地图上看去，如果把这种玩意用在人口稠密，医疗条件低下的印度次大陆，会是什么效果呢？不过刘芾也就是意淫一下，印度次大陆不像爪哇岛，联邦无法全面封锁哪里，也就无法控制细菌的传播范围，弄不好疫情会随着商人和水手。()传遍整个亚洲。到时候，整个武器就不是对付敌人的利器了，而是自杀的利器了。

对于内务部的报告，刘芾批准了。并且在报告中特别强调。大规模的上岛勘查工作。一定要注意安全和检疫，宁可再等3年，也不能去冒险。为了确保这项工作的执行力度，刘芾特意把这项任务同时下发给内务部和国防部军情局两个单位，让他们互相监督互相掣肘，免得那个单位头脑一热，快干冒进，那就麻烦了。

在得到总统批准之后，联邦海军和陆军各自抽调了一部分舰艇和部队，组成了一只特别登陆部队，归内务部和军情局双重领导，开始了对爪哇岛的部分占领。

最先被占领的就是爪哇岛上最大的城市，巴达维亚。这座东南亚最大的城市是由荷兰人在17世纪建立的，修建这座城市的石料不部分是从印度科罗曼德尔海岸石料场运来的，而木料则是从爪哇东部砍来的柚木，在加上在当地取材，由华人烧制了大量的砖才，经过13年的修建，才逐步完工。在当时修建巴达维亚城的劳工队伍中，就出现了华人包工队，当时的荷兰总督安东尼.范.迪门把城市下水、港口修建、城墙、防御要塞和部分房屋的建设都承包给了多支华人工程队，并且对华人烧制砖瓦和砌砖的工艺大卫赞赏。

这里曾经是荷兰东印度公司的总部，也是东南亚地区贸易最为发达的港口城市，不过，现在这里成了一座鬼城。随着疫情的加重，城市中的人要不染病而亡，要不逃出港口被联邦海军击沉，丧生大海，要不逃入了深山去躲避疾病和饥荒，现在的巴达维亚城，已经很久没有人的踪迹了，到处是倒塌的房屋和失火后的残迹，各种小型动物把这里当成了家园。

不光是巴达维亚城，爪哇岛沿海的所有城市基本上都是这样，这些城市中尸骨遍地、虫蛇众多，与其说叫城市，不如叫做废墟。