太平洋战争初期，南方军进展迅速，兵分四路作战，山下奉文的25军沿马来半岛——新加坡方向，本间雅晴的14军沿菲律宾方向，饭田祥二郎的15军沿缅甸——泰国——印度方向，今村均的16军沿爪哇方向。不到半年时间，南方军即侵占了新加坡、马来西亚、菲律宾、印度尼西亚以及南太平洋上的许多岛屿，攻占了10倍于日本本土、拥有富饶自然资源和1.5亿人口的大片土地。同时，日方损失甚微，包括海军在内，仅伤亡15000人，损毁飞机380架，驱逐舰4艘。

经过两年的时间，因为战局的一再失利，字去年后，日本就加强了南方派遣军的实力。在王汉章为进攻泰国之前，日军为撤离泰国之前。

第7方面军〈司令部在新加坡，司令官土肥原贤二〉：第29军（第37，第94师团，第37，第70旅团），第16军（第48师团，第28旅团），第37军（独立混成第56，第71旅团），直辖之第46师团，独立混成第26旅团，共计10万人，主要任务是防止盟军在马来亚、新加坡、婆罗洲、爪哇岛及苏门答腊。

第14方面军（司令部在吕宋）：第35军〈第1，第16，第26，第30,第100，第102师团，独立混成第54，第55旅团，步兵第68旅团〉，第41军（第8师团），直辖之第10，第19，第23，第103，第105，坦克第2师团，第1挺进集团，独立混成第58旅团，第4飞行师团。

1941年11月在南方军隶下设置第14军，作战地域配置在菲律宾方面。1942年10月改编升格成第14方面军，司令官本间雅晴，兵力20万人。

第18方面军（司令部在曼谷，司令官中村明人)：第15军（第4师团），直辖之第15，第22师团，独立混成第29旅团，曼谷防卫队，一共5万人。

南方军直辖：第14师团(独立混成第49，第53旅团），第2军（第5，第32，第35，第36师团，独立混成第57，第128旅团），第18军（第20，第41，第51师团）第38军〈第2，第21，第55旅团，独立混成第34旅团〉,第3航空军（第5，第9飞行师团，第55航空师团。人员25万人，由派遣军司令官寺内寿一指挥，作战区域在太平洋诸岛。

从兵力上来讲，日军的南方派遣军兵力雄厚，而且是日军最精锐的部队，如果不是美国在太平洋上猛烈的进攻，王汉章肯定会面临一场前所未有的大战，当然王汉章能走到今天也跟日军的战略格局小有关，日军开始没十分的在意，他们认为先击败美国，中国远征军就不足为虑，但是他在美国手中是一败再败，而远征军，王汉章却迅速的成长起来，日本因此错过了最佳的进攻时间。

瘟疫爆发后，驻扎印尼和马来的第七方面军面对汹涌的瘟疫，无力制止，他们只有十万人，却要稳住5、6千万的印尼土著，就算有土著兵协助，他们的人手还是不够，想杀都不知道从那里开始，同时也杀不过来，看似健康的人可能明天就发作了。

最后土肥原贤二只能对日本军队和侨民进行防护，而石原四郎也飞快的抵达了新加坡。

根据驻扎在当地的军医的报告，石原四郎看着病人的症状，很快意识到是他的研究成果，肯定是土著们来了印尼和新加坡，把这里的人传染了。

“土肥原君，根据下面的检验报告，和本人部下的亲自检查，本人已经可以确定这次瘟疫的病毒是本人研究所研究的新型细菌。不过我只是在泰国和柬埔寨使用了，本来是配合大本营消灭支那远征军的，但是没想到他们居然跑得比兔子还快，使得计划落空。”

“根据我本人在那里半个月的观察，瘟疫蔓延的速度非常的快，比在支那实验室爆发的更快，我综合了一下，一是这边的环境更适合细菌的滋生，而是这里的人口密集且不爱卫生，如今瘟疫已经全面爆发，虽然我们有药物可以救治，但是抱歉，药物造价昂贵，我没有那个能力去救几千万人，”石原四郎说道。

土肥原道：“石原君应该知道印尼、马来亚和越南同样的重要，这里有帝国最急需的资源，最重要的是石油资源，另外还能为几十万派遣军提供军粮，如果这里任由瘟疫爆发，那么经济就会遭到严重的破坏，不但没有了粮食，同时石油和其他矿产的正常生产怕是也会受到影响。”

“石原君，我不关心土著死多少，但是我在乎的是帝国在这里的利益，特别是帝国急需的物资，不管你用什么办法，无比保证正常的生产。”土肥原的话非常的严厉，让石原四郎都有点怕怕。